| Stasiun Cilejit | CJT | Bogor | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Cimahi | CMI | Cimahi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cimekar | CMK | Bandung | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cimindi | CMD | Bandung | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cimparuh | CPH | Pariaman | Jalur kereta api Lubuk Alung–Naras | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Ciomas | CS | Bogor | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cioyod | CY | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | — |
| Stasiun Cipari | CPI | Cilacap | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cipatat | CPT | Bandung Barat | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cipelah | CIL | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | — |
| Stasiun Cipeundeuy | CPD | Garut | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cipeuyeum | CPY | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cipinang | CPN | Jakarta Timur | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cipunegara | CRA | Subang | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cirahayu | CAA | Tasikmalaya | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Ciranjang | CRJ | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cirebon | CN | Cirebon | Jalur kereta api Cirebon–Semarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cirebon Prujakan | CNP | Cirebon | Jalur kereta api Cirebon–Semarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cireungas | CRG | Sukabumi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cireungit | CIG | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | — |
| Stasiun Ciroyom | COY | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | — |
| Stasiun Ciroyom | CIR | Bandung | jalur kereta api Andir–Bandung | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cisaat | CSA | Sukabumi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | — |
| Stasiun Cisauk | CSK | Tangerang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Cisomang | CG | Purwakarta | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cisurupan | CSN | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Citayam | CTA | Depok | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Citeras | CTR | Lebak | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Ciwidey | CWD | Bandung | Jalur kereta api Bandung–Ciwidey | — |
| Stasiun Comal | CO | Pemalang | Jalur kereta api Cirebon–Semarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Curahmalang | CRM | Jombang | Jalur kereta api Kertosono-Wonokromo | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Dadapan | DPA | Banyuwangi | — | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Danau Bale | — | Labuhanbatu | Jalur kereta api Kisaran-Rantauprapat | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Daru | DAR | Tangerang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Dawuan | DWN | Karawang | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Delanggu | DL | Klaten | Jalur kereta api Kutoarjo–Purwosari | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Depok | DP | Depok | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Depok Baru | DPB | Depok | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Dolok Merangir | DMR | Simalungun | Jalur kereta api Tebingtinggi-Siantar | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Doplang | DPL | Blora | Jalur kereta api Gambringan–Surabaya Pasarturi | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Duduk | DD | Gresik | Jalur kereta api Gambringan–Surabaya Pasarturi | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Duku | DUK | Padang Pariaman | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Duren Kalibata | DRN | Jakarta Selatan | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Duri | DU | Jakarta Barat | Jalur kereta api Tangerang-Duri | KAI Commuter |
| Stasiun Durian | DUR | Ogan Komering Ulu | Jalur kereta api Prabumulih–Panjang | — |
| Stasiun Dusun | DSU | Batu Bara | Jalur kereta api Tebingtinggi-Kisaran | — |
| Stasiun Gadobangkong | GK | Bandung Barat | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | — |
| Stasiun Gambir | GMR | Jakarta Pusat | Jalur kereta api lintas Jakarta | Kereta Api Indonesia |