| Stasiun Bungkaih | BKH | Aceh Utara | Jalur kereta api Krueng Mane–Krueng Geukueh | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Bunut | BUU | Asahan | Jalur kereta api Tebingtinggi-Kisaran | — |
| Stasiun Butuh | BTH | Purworejo | Jalur kereta api Cilacap–Yogyakarta | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cakung | CUK | Bekasi | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | KAI Commuter |
| Stasiun Candi Umbul | CAI | Magelang | Jalur kereta api Kedungjati–Secang | — |
| Stasiun Candimas | CMS | Lampung Utara | Jalur kereta api Prabumulih–Panjang | — |
| Stasiun Cangkring | CNK | Cirebon | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Caruban | CRB | Madiun | Jalur kereta api Solo Balapan-Madiun | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Catang | CT | Serang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cawang | CW | Jakarta Selatan | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Celangap | CEA | Bojonegoro | Jalur kereta api Gambringan–Surabaya Pasarturi | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cempaka | CEP | Lampung Utara | Jalur kereta api Prabumulih–Panjang | — |
| Stasiun Ceper | CE | Klaten | Jalur kereta api Kutoarjo–Purwosari | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cepu | CU | Blora | Jalur kereta api Gambringan–Surabaya Pasarturi | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cerme | CME | Gresik | Jalur kereta api Gambringan–Surabaya Pasarturi | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Ciamis | CI | — | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cianjur | CJ | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Ciawi | CAW | Tasikmalaya | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | — |
| Stasiun Cibadak | CBD | Sukabumi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cibatu | CB | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cibeber | CBB | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cibinong | CBN | Bogor | Lin Lingkar | KAI Commuter |
| Stasiun Cibitung | CIT | Bekasi | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | KAI Commuter |
| Stasiun Cibungur | CBR | Purwakarta | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cicalengka | CCL | Bandung | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cicayur | CC | Tangerang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Cicurug | CCR | Sukabumi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cidatar | CID | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | — |
| Stasiun Cigading | CGD | Cilegon | — | — |
| Stasiun Ciganea | CA | Purwakarta | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cigombong | CGB | Bogor | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cijulang | CIJ | Pangandaran | Jalur kereta api Banjar–Cijulang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cikadongdong | CD | Bandung Barat | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cikajang | CKG | Garut | Jalur kereta api Cibatu–Cikajang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cikampek | CKP | Karawang | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya | KAI Commuter |
| Stasiun Cikarang | CKR | Bekasi | Jalur kereta api Jakarta–Cikampek–Padalarang | KAI Commuter |
| Stasiun Cikaum | CKM | Subang | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cikeusal | CKL | Serang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cikini | CKI | Jakarta Pusat | Lin Bogor | KAI Commuter |
| Stasiun Cikoya | CKY | Tangerang | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | KAI Commuter |
| Stasiun Cikudapateuh | CTH | Bandung | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cilacap | CP | Cilacap | Jalur kereta api Kroya–Cilacap | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cilaku | CLK | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cilame | CLE | Bandung Barat | Jalur kereta api Cikampek-Padalarang | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cilebut | CLT | Bogor | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan | KAI Commuter |
| Stasiun Ciledug | CLD | Cirebon | Jalur kereta api segitiga Cirebon–Prupuk–Tegal | Kereta Api Indonesia |
| Stasiun Cilegeh | CLH | Indramayu | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya | — |
| Stasiun Cilegon | CLG | Cilegon | Jalur kereta api Anyer Kidul–Kampung Bandan | — |