| Halte Air Tawar | ATR | Padang | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung |
| Halte Bangsal | BSL | Mojokerto | Jalur kereta api Kertosono-Wonokromo |
| Halte Banjarkemantren | BJK | Sidoarjo | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Batu Limbak | BMK | Tanah Datar | Jalur kereta api Padang Panjang–Sawahlunto |
| Halte Buduran | BDR | Sidoarjo | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Buwek | BWK | Lumajang | Jalur kereta api Bangil-Kalisat |
| Halte Cijambe | CJE | Sukabumi | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Halte Gebang | GEL | Blitar | Jalur kereta api Bangil-Kertosono |
| Halte Jemursari | JMS | Surabaya | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Jetis (Grobogan) | JIS | Grobogan | Jalur kereta api segitiga Brumbung–Gundih–Gambringan |
| Halte Jorongan | JOR | Probolinggo | Jalur kereta api Bangil-Kalisat |
| Halte Kalimenur | KLR | Kulon Progo | Jalur kereta api Kutoarjo–Purwosari |
| Halte Kepet | KEP | Tuban | Jalur kereta api Babat-Tuban |
| Halte Kertomenanggal | KTL | Surabaya | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Klotok | KOK | Tuban | Jalur kereta api Babat-Tuban |
| Halte Krikilan | KKL | Banyuwangi | Jalur kereta api Kalisat-Banyuwangi |
| Halte Kumendung | KMG | Sidoarjo | Jalur kereta api Kertosono-Wonokromo |
| Halte Kurai Taji | KI | Pariaman | Jalur kereta api Lubuk Alung–Naras |
| Halte Lubuk Buaya | LBY | Padang | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung |
| Halte Maleber | MLB | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Halte Margorejo | MGR | Surabaya | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Ngagel | NGA | Surabaya | Jalur kereta api lintas Surabaya |
| Halte Pagerwojo | PWJ | Sidoarjo | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Panyuran | PYR | Tuban | Jalur kereta api Babat-Tuban |
| Halte Pauh Kambar | PAK | Padang Pariaman | Jalur kereta api Lubuk Alung–Naras |
| Halte Rancakole | RCL | Banjar | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Halte Sawotratap | STP | Sidoarjo | Jalur kereta api Wonokromo–Bangil |
| Halte Sindangresmi | SSI | Cianjur | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Halte Sukosari | SSR | Jember | Jalur kereta api Kalisat-Panarukan |
| Halte Sumberbaru | SBB | Jember | Jalur kereta api Bangil-Kalisat |
| Halte Sumbersalak | SBS | Jember | Jalur kereta api Kalisat-Banyuwangi |
| Halte Tarandam | TDA | Padang | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung |
| Halte Widuri | WDR | Bondowoso | Jalur kereta api Kalisat-Panarukan |
| Kampung Tangah railway station | KPG | Tanah Datar | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung |
| Museum Kereta Api Bondowoso | BO | Bondowoso | Jalur kereta api Kalisat-Panarukan |
| Museum Kereta Api Sawahlunto | SWL | Lembah Segar | Jalur kereta api Padang Panjang–Sawahlunto |
| Stasiun Aek Nabara | — | Labuhanbatu | Jalur kereta api Kisaran-Rantauprapat |
| Stasiun Alai | AI | Padang | Jalur kereta api Bukit Putus–Lubuk Alung |
| Stasiun Alastua | ATA | Semarang | Jalur kereta api Cirebon–Semarang |
| Stasiun Andir | AND | Bandung | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Stasiun Anyer Kidul | ANK | Serang | — |
| Stasiun Araskabu | ARB | Deli Serdang | Jalur kereta api Medan–Tebing Tinggi |
| Stasiun Argopuro | AGO | Banyuwangi | Jalur kereta api Kalisat-Banyuwangi |
| Stasiun Arjasa | AJ | Jember | Jalur kereta api Bangil-Kalisat |
| Stasiun Arjawinangun | AWN | Cirebon | Jalur kereta api Cikampek–Cirebon–Kroya |
| Stasiun Awipari | AW | Tasikmalaya | Jalur kereta api Bogor–Padalarang–Kasugihan |
| Stasiun Babadan | BBD | Madiun | Jalur kereta api Solo Balapan-Madiun |
| Stasiun Babakan | BBK | Cirebon | Jalur kereta api segitiga Cirebon–Prupuk–Tegal |