IAIN Purwokerto siapkan 100 beasiswa kuliah gratis hingga wisuda (semester 8) bagi Mahasiswa yang terpilih di Penerimaan Mahasiswa Baru tahap 4 yang akan dibuka mulai 26 Agustus sampai dengan 5 September 2020. Selain itu disediakan juga beasiswa bagi pemegang Kartu Indonesia Pintar (KIP) Kuliah untuk 45 mahasiswa. Beasiswa tersebut akan diberikan kepada mahasiswa baru yang lolos seleksi melalui jalur PMB Mandiri tahap 4 khusus untuk Program Studi Manajemen Zakat Wakaf (MZW), Studi Agama Agama (SAA), Perbandingan Mazhab (PMA), Pengembangan Masyarakat Islam (PMI) dan Pendidikan Islam Anak Usia Dini (PIAUD). Beasiswa diprioritaskan bagi mahasiswa yang berasal dari keluarga yang tidak mampu atau mahasiswa yang memiliki prestasi minimal juara 1 perseorangan tingkat kabupaten. Namun tetap ada peluang bagi mahasiswa yang berasal dari keluarga mampu maupun tidak memiliki prestasi selama kuota masih tersedia. Rincian beasiswa per program studi dapat dilihat di bawah ini:
